贯彻落实国家、省、市有关财政支农政策，研究提出支持农业、农村发展的相关财政政策；制定财政支农资金管理办法；负责财政支农专项资金及水务资金的管理；负责农业、水利、水务等基本建设资金管理；负责农业保险、农业防灾救灾资金管理；负责防洪保安资金、农业发展基金、水利建设基金等专项资金的筹集、使用、管理；负责城乡一体化发展综合配套改革专项资金管理及相关工作；负责市级农口企业的财务管理等相关工作；参与编制农业综合开发规划和年度计划，负责农业综合开发项目资金、财务管理。
管理指导全市区镇财政工作；负责到村的有关财政政策研究制定和项目资金管理；参与有关涉农补贴政策研究，指导其在基层的落实，负责发放各项涉农补贴资金；配合有关部门监督中央和省、市对乡镇专项转移支付资金的使用，监督强农惠农资金使用；参与新农村建设相关政策的调研和制定；参与村级集体资产管理、资金管理、农民负担等政策的研究和制定。