负责水域及其岸线的管理和保护，指导江河湖泊、河口的开发、治理和保护，负责河湖水生态保护与修复以及河湖水系连通工作；负责开展“清四乱”及河道保洁工作；监督管理河道采砂工作，指导河道采砂规划和计划的编制，组织实施河道管理范围内工程建设方案审查制度；组织指导有关防洪论证工作；承担洪水影响评价等工作；完成局党组交办的其他工作。