药王洞遗址位于湘西自治州花垣县边城镇，为旧石器时代遗址。

史前文化堆积分上下两部分。下部堆积属旧石器时代晚期;上部堆积包含新石器时代早期的文化要素。发现挡土墙遗迹1处。出土打制石器61件,磨制石器1件,以及熊、牛等动物化石。

通过对花垣药王洞动物骨胶原蛋白提取分析，证明骨样距今已有3万多年。由此表明，3万多年前的湘西边城茶峒已有人类活动，湘西先民已在沅水与酉水及支流清水江边洞穴与台地上过着渔猎生活。

2019年3月，花垣药王洞遗址入选湖南省第十批省级文物保护单位名单。