（一）监督指导农用地、农业生物物种资源及农产品产地环境保护与管理。配合相关部门指导农业面源污染防治，指导农产品产地环境监测。组织开展全市农业环境影响评价，负责农业环境污染综合防治示范区建设。组织开展农业废弃物无害化处理与资源化利用工作。
（二）指导农村可再生能源体系建设。承担农村可再生能源的监督管理、开发利用，指导农业生物质能源产业发展，牵头秸秆综合利用工作。会同相关单位拟定畜禽养殖禁养、限养区划定方案，并监督实施。
（四）牵头农业农村生态文明建设工作。负责全市农业清洁生产、节能减排和生态循环农业建设。协助做好长江经济带生态环境建设工作。
（五）负责农业野生植物资源保护、开发利用工作；承担外来物种管理相关工作。
（六）组织指导重金属污染耕地修复和安全利用工作。
（七）承担全市农村能源与农业资源环境信息统计工作。
（八）完成市委农办、农业农村局领导交办的其他任务