指导水利工程建设管理，拟订有关制度并组织实施。指导水库、水闸、堤防等水利基础设施建设，指导重要病险水库（水闸）、重要堤防的除险加固。组织指导水利工程蓄水安全鉴定和验收。组织实施水利工程质量监督。指导水利建设市场的监督管理和水利建设市场信用体系建设。组织开展大中型灌排工程建设与改造，指导农村饮水安全工程建设管理工作与节水灌源有关工作。承担水能资源的监督管理工作。组织拟订农村水能资源开发规划，指导水电农村电气化、农村水电增效扩容改造以及小水电代燃料等农村水能资源开发工作。指导农村水利改革创新和社会化服务体系建设。负责行政许可事项的统一受理、审核或审批和送达；组织协调行政许可事项的调研论证；负责行政许可事项办理资料归档和信息统计工作；承担本部门行政审批事项的日常管理；负责建立行政审批事项监督管理制度，并组织实施;负责牵头实施部门权力清单制度有关工作。