负责全市地表水生态环境监管工作，组织编制水功能区划，拟订和监督实施水环境保护目标和水污染防治专项规划、重点流域生态环境规划，建立和组织实施跨县界水体断面水质考核制度，监督管理饮用水源地生态环境保护工作，指导入河排污口设置管理，协助管理黑臭水体整治工作。