拟订全市重大疾病防治规划、免疫规划、严重危害人民健康的公共卫生问题的干预措施并组织实施；完善疾病预防控制体系；承担传染病疫情信息发布工作；承担职责范围内的学校常见病防控；拟订全市血吸虫病防治工作政策，协调有关部门开展血吸虫病的综合防治工作，负责全市血吸虫病防治的业务技术管理。
承担卫生应急和紧急医学救援工作；组织编制专项预案，承担预案演练的组织实施和指导监督工作；指导卫生应急体系和能力建设；发布突发公共卫生事件应急处置信息。