承担深化医药卫生体制改革工作，研究提出全市深化医药卫生体制改革政策、措施的建议；承担组织推进公立医院综合改革工作；负责组织协调基层医疗卫生机构综合改革工作。贯彻执行国家药物政策和国家基本药物制度；拟订药物政策和基本药物使用管理措施并组织实施；开展药品使用监测、临床综合评价、短缺药品监测预警；提出医疗服务和药品价格政策的建议。