拟订全市重大疾病防治规划、免疫规划、严重危害人民健康的公共卫生问题的干预措施并组织实施，完善疾病预防控制体系，防止和控制疾病的发生和疫情的蔓延；承担传染病疫情信息的报告工作；贯彻落实食品安全标准，开展食品安全风险监测、评估和交流，配合上级部门开展食品安全企业标准备案工作；承担市政府血吸虫病地方病防治领导小组、市政府艾滋病防治工作委员会、市精神病防治康复工作领导小组办公室的日常工作。负责拟订健康昆山建设职责分工方案、年度计划和相关制度，并协调组织实施；组织开展健康教育、健康促进活动；组织对全市各区镇、各城市管理办事处、各部门推进健康昆山建设工作的指导与督查、考核和评估；开展重大问题调研；承担健康昆山建设相关组织机构日常工作；承担市爱国卫生运动与健康促进委员会办公室工作，指导卫生城镇、健康城镇创建和考核评价工作。