负责严格依照法律法规规定的条件和程序办理器械产品注册并承担相应责任，优化注册管理流程，组织实施分类管理，监督实施药品、医疗器械质量管理规范；承担药品、医疗器械生产许可监督工作。掌握分析药品、医疗器械安全形势、存在问题并提出完善制度机制和改进工作的建议，发布药品、医疗器械质量公告。严格依法履行监督管理责任，及时发现、纠正为符合不当行为。负责药品、医疗器械广告监测工作；组织开展药品、医疗器械不良事件监测、再评估。负责药品（包括特殊药品）、医疗机构制剂（配制）日常监管工作；组织实施合理用药工作；监督执行处方药与非处方药分类管理制度；指导和实施农村用药供应网、监督强建设；负责药品电子监管工作。
负责保健食品、化妆品制剂（配制）日常监管工作；依法承担保健食品、化妆品质量监督管理工作。负责保健食品、化妆品电子监管工作；掌握分析保健食品、化妆品安全形势、存在问题并提出完善制度机制和改进工作的建议。监督实施保健食品、化妆品质量管理规范；负责保健食品、化妆品经营企业的日常监管工作；负责互联网保健食品、化妆品交易服务行为和信息的监督工作；负责保健食品、化妆品广告监测工作。