指导全市道路、水路客货运输和运输服务市场的行业管理;负责城乡客运及有关设施规划监督管理工作；参与拟订全市物流业发展有关政策，按规定负责物流市场有关指导监督工作；指导交通运输业户和交通运输外资、合资企业的资质审查；指导全市汽车综合性能检测、汽车（含摩托车）驾驶学校和驾驶员培训考试的行业管理；指导和协管运输及运输服务价格；指导全市交通运输行业节能减排工作；负责全市春运组织协调工作；负责制定交通运输行业地方标准和行业计量工作；参与指导交通运输综合行政执法机构运政执法工作；参与优化交通运输主要通道和重要枢纽节点布局。
指导全市海事管理工作，指导港口、岸线、水上交通运输设施、船舶和浮动设施管理、检验监督工作；负责航道管理、航标设置以及航道通航技术标准审核审查工作和协调水资源综合利用、航道通航条件影响评估；负责编制海事监督、航道、港航的新建改建（养护）工程项目年度计划；参与指导全市水路运输及运输服务业的行业管理工作；参与编制全市水路交通发展规划计划；指导监督水路工程建设，参与拟定水路工程质量安全监督管理办法；牵头负责水路基本建设项目的绩效监督和管理工作；参与组织协调水上突发事件应急处置工作；参与指导全市水上交通安全监督，指导防止船舶污染水域、通航秩序和通航环境管理工作；参与调查、处理水上交通事故和船舶污染事故；指导船员培训、船员考试有关工作；按规定权限管理和发布航行警（通）告；指导监督渔船检验工作；组织协调全市交通运输系统防汛抗旱工作；参与指导交通运输综合行政执法机构水上安全执法工作。
贯彻执行国家国防交通工作的方针、政策和法律、法规、规章，拟订本市有关国防交通工作的规定；负责拟订全市国防交通保障中长远规划和年度计划并组织实施，为全市的军事行动和其他紧急任务组织交通保障；负责国防交通的工程管理和国防运力的动员组织工作；指导、检查、监督全市的国防交通工作，协调处理有关问题。