（一）参与联系部门（单位）行业发展规划、相关政策制度的制定，协助其建立财政支持项目库。
（二）指导联系部门（单位）开展预算编制、执行、调整，审核批复其预决算，对其有关转移支付和专项资金进行管理、分配，对其进行财政监督、预算绩效管理。
（三）负责上级渔业成品油改革价格补贴资金、中央彩票公益金（用于扶贫开发部分）、种粮农民农业支持保护补贴的财务管理、分配和使用监督。
（四）负责研究制定和组织实施财政支农政策，统筹协调涉农资金整合，推进农村综合改革，指导基层财政部门加强农村集体经济财务管理。
（五）承担局行业扶贫领导小组办公室职能。
（六）办理局领导交办的其他事项。