（一）拟订全市创新驱动发展战略以及科技发展规划、计划和政策，并组织实施和监督检查。
（二）统筹推进全市科技创新体系建设和科技体制改革，指导科研机构改革发展和新型研发机构建设，推动企业科技创新能力建设，承担推进科技与金融结合、科技军民融合发展相关工作。会同有关部门健全科技创新激励机制，推进重大科技决策咨询制度建设。
（三）牵头建立市级科技管理平台和科技计划项目资金协调、评估、监管机制，组织管理市级科技计划（专项等）并监督实施。会同有关部门提出优化配置科技资源的政策措施建议，推动多元化科技投入体系建设。
（四）编制市级科技计划并组织实施，统筹基础研究、前瞻原创技术、关键核心技术、现代工程技术、产业变革技术等研发和创新，牵头组织重大技术攻关和重大科技成果转化产业化和应用示范。
（五）拟订科学与工程研究、技术创新与成果转化、基础设施与条件保障等基地平台布局规划并组织实施，参与组织重大科技基础设施建设。指导科技社会组织相关管理工作。推动科研条件保障建设和科技资源统筹开放共享。
（六）组织拟订高新技术发展及产业化、科技促进农业农村和社会发展的规划、政策和措施。组织开展重点领域技术发展需求分析，提出重大任务并监督实施。
（七）负责全市技术转移体系建设，拟订科技成果转移转化及产业化和促进产学研结合、科技知识产权创造的相关政策措施。指导科技服务业、技术市场和科技中介组织发展。
（八）统筹区域科技创新体系建设，指导区域创新发展、科技资源合理布局和协同创新能力建设。推动创新型县市、创新型乡镇建设。
（九）负责高新技术产业开发区指导服务协调和管理工作，组织指导各类科技园区和创新创业载体建设。会同有关部门开展高新技术企业等的初审推荐和相关管理工作。
（十）负责科技监督评价体系建设和相关科技评估管理，指导科技评价机制改革，统筹科研诚信建设。组织实施全市创新调查。指导科技安全和科技保密相关工作。
（十一）会同有关部门拟订科技人才队伍建设规划和政策，建立健全科技人才评价和激励机制，组织实施科技人才计划，推动高端科技创新人才队伍建设。参与拟订科学普及和科学传播规划、政策。
（十二）拟订国际科技合作与交流的政策和措施，协调推进跨国（境）技术转移工作，指导国际科技合作基地和外资研发机构建设。
（十三）负责全市引进国外智力和外国专家管理工作。拟订引进外国专家规划、计划并组织实施。建立重点外国专家、团队吸引集聚联系服务机制。拟订出国（境）培训规划、年度计划并监督实施。负责外国人才、人员工作许可等事项。
（十四）负责社会力量设立科学技术奖管理工作。
（十五）认真履行部门安全生产、消防安全、生态文明建设的工作职责和责任。
（十六）拟订昆山对台科技合作与交流的政策措施，推进昆山深化两岸产业合作试验区建设。
（十七）完成市委、市政府交办的其他任务。
（十八）职能转变。围绕贯彻实施创新驱动发展战略，加强、优化、转变政府科技管理和服务功能，完善科技创新制度和组织体系，加强宏观管理和统筹协调，减少微观管理和具体审批事项，加强事中事后监管和科研诚信建设。从研发管理向创新服务转变，深入推进科技计划管理改革，减少科技计划项目重复、分散、封闭、低效和资源配置“碎片化”的现象。加强科技创新规划布局和绩效评价，建立健全以创新能力、质量、贡献、绩效为导向的科技评价体系和激励政策。